医疗机构产生废水的主要部门和设施包括诊疗室、化验室、病房、洗衣房、X光照相洗印、动物房、同位素治疗诊断、手术室等；另外，食堂、宿舍等产生生活污水。

    医疗废水的主要污染物包括：1）病原性微生物，如细菌等；2）有毒、有害的物理化学污染物；3）放射性污染物；4）CODCr、BOD5、氨氮等常规污染物。

     此次疫情中的新型冠状病毒和其他所有的病毒一样，没有细胞壁，不是完整的细胞结构，只含一种核酸（DNA或RNA），必需在活的宿主细胞中才能得以复制繁殖，冠状病毒开生物宿主后活性会逐渐消失；此外，冠状病毒为人传人的病毒，不会脱离某个载体（比如血液、体液、唾液、飞沫等等）独立飘散离在空气中。2月1日，深圳卫健委发布消息，研究者在新冠肺炎#确诊患者粪便中检出病毒RNA阳性，表示粪便具有一定的传染性。

     新型冠状病毒疫情定点收治的医院或医疗点废水中不可避免的会有离开宿主后活性逐渐消失的新型冠状病毒（离开宿主后，新型冠状病毒能存活的时间尚无定论）。医疗机构医疗废水基本都为间接排放，即医疗机构一般都有废水的处理设施，处理完后通过市政管网排入城镇污水处理厂。通常情况下，医院医疗的废水处理工艺实验室废水处理设备均有使用盐酸或次氯酸钠等消毒剂对废水进行消毒的环节，强酸性条件对病毒或细菌都有很好的杀灭效果。在消毒环节之前，化粪池处理、格栅处理、和沉淀处理都基本在密闭的环境下进行，极少医院有敞开曝气处理的环节，在曝气处理时，如果废水中的病毒没有血液、体液、唾液、飞沫等传播载体，基本不会对污水处理设施运营工作人员构成传染的威胁。